Các đặc tính cá biệt của việc cầu nguyện trong PTTNTT bắt nguồn từ truyền thống tâm linh của Hội Tông Đồ Cầu nguyện mà PT/TNTT là thành viên. Phong trào luôn tìm cách dạy cho giới trẻ biết sống trong một mối quan hệ bạn hữu luôn mãi với Chúa, biết tìm Thiên Chúa trong mọi sự. Lời cầu nguyện của họ sẽ luôn được bắt đầu từ trong cuộc sống và kết hiệp làm một với cuộc sống, đồng thời, nó như được đặt nền tảng trong Lời Chúa hầu hướng dẫn họ trở thành một tông đồ biết phục vụ thế giới trong Giáo Hội.